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PlantScreen高通量植物表型成像分析平臺(tái)(傳送帶版)(一)

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北京易科泰生態(tài)技術(shù)有限公司成立于2002年,為國(guó)家*,致力于生態(tài)-農(nóng)業(yè)-健康研究監(jiān)測(cè)技術(shù)推廣、研發(fā)與服務(wù),特別是在光譜成像技術(shù)(高光譜成像技術(shù)、葉綠素?zé)晒獬上窦夹g(shù)、紅外熱成像技術(shù)、無(wú)人機(jī)遙感等)、植物表型分析技術(shù)、呼吸與能量代謝測(cè)量技術(shù)等方面,與企業(yè)PSI、Specim、Sable等合作,致力于植物科學(xué)、土壤與地球科學(xué)、動(dòng)物能量代謝、水體與藻類及生態(tài)環(huán)境領(lǐng)域*儀器技術(shù)的引進(jìn)推廣和技術(shù)研發(fā)集成,為植物/作物表型分析、生態(tài)修復(fù)及生態(tài)保護(hù)、能量代謝測(cè)量等提供規(guī)劃設(shè)計(jì)、技術(shù)方案與系統(tǒng)集成、技術(shù)咨詢與科技服務(wù)。公司技術(shù)團(tuán)隊(duì)80%以上具備碩士或碩士以上學(xué)位,并與*研究生院、中科院植物研究所、中科院動(dòng)物所、中科院地理科學(xué)與資源研究所、中國(guó)農(nóng)科院、中國(guó)林科院、中國(guó)環(huán)科院、中國(guó)水科院、清華大學(xué)、中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)、北京林業(yè)大學(xué)、北京大學(xué)、中國(guó)海洋大學(xué)、陜西師范大學(xué)、內(nèi)蒙古大學(xué)等建立了*的技術(shù)合作交流關(guān)系。 公司下設(shè)有葉綠素?zé)晒饧夹g(shù)與植物表型業(yè)務(wù)部、EcoLab?實(shí)驗(yàn)室、光譜成像與無(wú)人機(jī)遙感事業(yè)部及無(wú)人機(jī)遙感研究中心(與陜西師范大學(xué)合作建立)、動(dòng)物能量代謝實(shí)驗(yàn)室、內(nèi)蒙古阿拉善蒙古牛生態(tài)牧業(yè)研究院及青島分公司。實(shí)驗(yàn)室擁有葉綠素?zé)晒獬上?、葉綠素?zé)晒鈨x、水體藻類熒光儀、SPECIM高光譜儀、WORKSWELL紅外熱成像儀、EasyChem*、MicroMac1000水質(zhì)在線監(jiān)測(cè)系統(tǒng)、ACE土壤呼吸自動(dòng)監(jiān)測(cè)系統(tǒng)、SoilBox便攜式土壤氣體通量測(cè)量系統(tǒng)、動(dòng)物呼吸測(cè)量系統(tǒng)、LCpro+光合作用測(cè)量?jī)x、Hood土壤入滲儀、年輪分析儀等各種儀器設(shè)備,可以進(jìn)行實(shí)驗(yàn)研究分析、實(shí)驗(yàn)培訓(xùn)等,歡迎與易科泰生態(tài)研究室開(kāi)展合作研究。 易科泰公司與歐洲PSI公司(葉綠素?zé)晒饧夹g(shù)與表型分析技術(shù))、美國(guó)SABLE公司(動(dòng)物能量代謝技術(shù))、歐洲SPECIM公司(高光譜成像技術(shù))、歐洲WORKSWELL公司(紅外熱成像技術(shù))、歐洲Lightigo公司(LIBS元素分析技術(shù))、歐洲BCN無(wú)人機(jī)遙感中心、歐洲ITRAX公司(樣芯密度掃描與元素分析)、美國(guó)VERIS公司、英國(guó)ADC公司、德國(guó)UGT公司、歐洲SYSTEA公司等*生態(tài)儀器技術(shù)領(lǐng)域的研發(fā)機(jī)構(gòu)和廠商建立了密切的合作關(guān)系,在FluorCam葉綠素?zé)晒獬上衽c熒光測(cè)量技術(shù)、PlantScreen植物表型分析技術(shù)、高光譜成像技術(shù)、紅外熱成像技術(shù)、光合作用與植物生態(tài)研究監(jiān)測(cè)、土壤呼吸與碳通量研究監(jiān)測(cè)、動(dòng)物呼吸代謝測(cè)量、水質(zhì)分析與藻類研究監(jiān)測(cè)、CoreScanner樣芯密度CT與元素分析技術(shù)、LIBS元素分析技術(shù)、無(wú)人機(jī)生態(tài)遙感技術(shù)等生態(tài)儀器技術(shù)及其系統(tǒng)方案集成有著豐富的經(jīng)驗(yàn),成為我國(guó)農(nóng)業(yè)、林業(yè)、地球科學(xué)、生態(tài)環(huán)境研究等領(lǐng)域科技進(jìn)步的重要研究力量。由公司研制生產(chǎn)的EcoDrone?無(wú)人機(jī)遙感平臺(tái)、SoilTron?多功能小型蒸滲儀技術(shù)、SoilBox?土壤呼吸測(cè)量技術(shù)、PhenoPlot?輕便型作物表型分析系統(tǒng)、SCG-N土壤剖面CO2/O2梯度監(jiān)測(cè)系統(tǒng)、植物生態(tài)監(jiān)測(cè)技術(shù)、動(dòng)物能量代謝測(cè)量技術(shù)等,在中科院修購(gòu)項(xiàng)目、*學(xué)科群項(xiàng)目、CERN網(wǎng)絡(luò)(生態(tài)系統(tǒng)監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò))等項(xiàng)目中發(fā)揮重要作用 “工欲善其事,必先利其器”,易科泰公司將秉承“利其器,善其事”的經(jīng)營(yíng)理念,為國(guó)內(nèi)生態(tài)-農(nóng)業(yè)-健康研究與發(fā)展提供的技術(shù)方案和服務(wù)。
激光產(chǎn)品,數(shù)據(jù)采集器
PlantScreen高通量植物表型成像分析平臺(tái)(傳送帶版)(一) 產(chǎn)品信息

PlantScreen高通量植物表型成像分析平臺(tái)(傳送帶版)(一)

PlantScreen高通量植物表型成像分析平臺(tái)由公司PSI公司研制生產(chǎn),整合了LED植物智能培養(yǎng)、自動(dòng)化控制系統(tǒng)、葉綠素?zé)晒獬上駵y(cè)量分析(可擴(kuò)展多光譜熒光成像)、植物熱成像分析、植物近紅外成像分析、RGB真彩3D成像、高光譜成像、3D激光掃描成像分析、RhizoTron根系成像分析、自動(dòng)條碼識(shí)別管理、自動(dòng)稱重與澆灌系統(tǒng)等多項(xiàng)*技術(shù),以化的方式實(shí)現(xiàn)大量植物樣品的功能與形態(tài)結(jié)構(gòu)自動(dòng)成像分析,用于玉米、水稻、小麥、大豆及椰樹(shù)等熱帶作物高通量表型成像分析測(cè)量、脅迫響應(yīng)成像分析測(cè)量、生長(zhǎng)分析測(cè)量、生態(tài)毒理學(xué)研究、性狀識(shí)別、抗性篩選、作物遺傳育種及植物生態(tài)分析研究等。

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PlantScreen技術(shù)特點(diǎn):

1.模塊式結(jié)構(gòu),配置靈活,可選配不同的功能模塊,系統(tǒng)具備強(qiáng)大的可擴(kuò)展性

2.的FluorCam葉綠素?zé)晒獬上窦夹g(shù),是作物生態(tài)功能性狀的*分析技術(shù),配備*的高靈敏度葉綠素?zé)晒獬上耒R頭,成像面積可選配35cm x 35cm或80cm x 80cm

3.可選配不同的表型成像分析模塊:

1)葉綠素?zé)晒獬上駟卧瑔畏上衩娣e35cm x 35cm或選配80cm x 80cm

2)多激發(fā)光、多光譜熒光成像模塊,包括GFP等熒光蛋白成像、多光譜熒光成像分析等

3)3D RGB可見(jiàn)光成像分析單元,包括頂部和側(cè)面兩個(gè)高分辨率RGB鏡頭、0-360度旋轉(zhuǎn)平臺(tái)、光源燈

4)高光譜成像分析單元,有VNIR高光譜和SWIR高光譜供選配

5)紅外熱成像分析單元(標(biāo)配頂部2維成像分析,可選配頂部與側(cè)面3D成像分析),用于對(duì)植物干旱脅迫、氣孔導(dǎo)度成像分析

6)3D激光掃描單元,用于對(duì)作物3D點(diǎn)云模型和形態(tài)結(jié)構(gòu)分析,PSI專業(yè)技術(shù),可以把葉綠素?zé)晒獬上?、高光譜成像等投射到3D點(diǎn)云模型上進(jìn)行3D分析、作物生長(zhǎng)模型研究等

7)根系成像分析單元,RhizoTron根窗技術(shù)

8)NIR(近紅外)成像單元,用于對(duì)植物水分狀態(tài)分析,可選配3D近紅外成像

9)自動(dòng)稱重與澆灌系統(tǒng)

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4.世界的智能LED光適應(yīng)室,確保作物表型成像分析前穩(wěn)定可比的光適應(yīng)和暗適應(yīng)

5.Shoot & Root Phenotyping全面分析植物表型

6.植物傳送系統(tǒng)可根據(jù)客戶需求定制、擴(kuò)展

7.客戶定制智能LED溫室或作物生長(zhǎng)室(選配),可模擬晝夜節(jié)律、多云天氣等,傳送系統(tǒng)可自動(dòng)將植物從生長(zhǎng)室中傳送至光適應(yīng)室然后進(jìn)入成像室進(jìn)行成像分析,并遠(yuǎn)程在線瀏覽分析

8.功能強(qiáng)大的操作系統(tǒng)及作物表型大數(shù)據(jù)平臺(tái),具備葉片跟蹤監(jiān)測(cè)功能、3D投射功能

9.PSI表型研究中心專家團(tuán)隊(duì),每年在美國(guó)和歐洲分別組織舉辦一次世界植物表型研討會(huì)

植物表型分析技術(shù)應(yīng)用情況

作為家研制生產(chǎn)FluorCam植物葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng)的廠家,PSI公司在植物表型成像分析領(lǐng)域處于的技術(shù)前列,其FluorCam葉綠素?zé)晒獬上裣到y(tǒng)應(yīng)用于植物表型分析研究,代表性論文如Celine Rousseau等(High throughput quantitative phenotyping of plant resistance using chlorophyll fluorescence image analysis, Plant Methods 2013)。在FluorCam技術(shù)基礎(chǔ)上集成RGB 3D成像分析、高光譜成像分析、近紅外成像分析、紅外熱成像分析及激光雷達(dá)掃描分析等*技術(shù)的PlantScreen全自動(dòng)高通量植物表型成像分析平臺(tái),成為目前世界上的表型組學(xué)和作物遺傳育種研究設(shè)備(應(yīng)用案例另附)。

系統(tǒng)配置與工作原理:

整套系統(tǒng)由自動(dòng)化植物傳送系統(tǒng)、光適應(yīng)室、FluorCam葉綠素?zé)晒獬上瘛GB成像、高光譜成像、根系成像、植物紅外熱成像、植物近紅外成像、自動(dòng)澆灌與稱重系統(tǒng)、植物標(biāo)識(shí)系統(tǒng)、控制系統(tǒng)及表型大數(shù)據(jù)平臺(tái)等組成,溫室或生長(zhǎng)室內(nèi)植物通過(guò)自動(dòng)識(shí)別傳送系統(tǒng)運(yùn)送到光適應(yīng)室內(nèi),然后進(jìn)行必要的澆灌稱重,再由傳送帶到成像室進(jìn)行成像分析等,后植物自動(dòng)返回原位。系統(tǒng)服務(wù)器及數(shù)據(jù)分析平臺(tái)在線采集分析并自動(dòng)存儲(chǔ)至數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)

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技術(shù)指標(biāo):

1. image.png光適應(yīng)室:

·對(duì)作物成像分析前進(jìn)行均一穩(wěn)定的光適應(yīng)或暗適應(yīng),以確保植物表型分析數(shù)據(jù)的可靠性

·智能冷白LED(6500K)+遠(yuǎn)紅LED(735nm)光源,對(duì)植物*升溫效應(yīng),光強(qiáng)1000 μmoles /m2/s 0-*(步進(jìn)增幅1%)可調(diào)

·適應(yīng)室內(nèi)由通風(fēng)系統(tǒng)保持空氣交流通風(fēng)

·具備植物高度激光監(jiān)測(cè)系統(tǒng),以根據(jù)高度調(diào)整成像高度等

·具備*,以調(diào)整控制植物移動(dòng)與成像程序(imaging protocols)的同步性

·垂直簾門確保與環(huán)境光線及成像系統(tǒng)的隔離

·具備IP監(jiān)測(cè)鏡頭以始終保持對(duì)系統(tǒng)運(yùn)行和植物移動(dòng)狀況的監(jiān)視

·規(guī)格容量8盆/培養(yǎng)托

2.RGB 3D結(jié)構(gòu)成像分析單元?

a)2個(gè)高分辨率RGB鏡頭(頂部和側(cè)面),新一代CMOS彩色傳感器,分辨率12.8Mpix(4096x3000),像素大小3.45µm

b)成像高度可客戶定義或設(shè)置,范圍0-1050mm,精確度3mm

c)360度旋轉(zhuǎn)平臺(tái)、LED均一光源照明

d)數(shù)據(jù)傳輸:千兆以太網(wǎng)

e)測(cè)量參數(shù):葉面積、植物緊實(shí)度/緊密度、葉片周長(zhǎng)、偏心率、葉圓度、葉寬指數(shù)、植物圓直徑、凸包面積、植物質(zhì)心、生長(zhǎng)高度、植物大高度和寬度、相對(duì)生長(zhǎng)速率等

f)可進(jìn)行顏色分割分析、植物適合度評(píng)價(jià)、實(shí)驗(yàn)生*葉面積動(dòng)態(tài)變化比較分析、綠度指數(shù)、顏色分級(jí)分析(健康綠色、亮綠色、暗綠色、其他顏色)等表型參數(shù)

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3.FluorCam葉綠素?zé)晒獬上駟卧?/span>

a)成像面積:35×35cm或選配80x80cm

b)橙色620nm LED脈沖調(diào)制測(cè)量光源

c)雙色光化學(xué)光,橙色620nm LED和冷白LED光源

d)冷白LED飽和光閃,大光強(qiáng)4000 µmol(photons)/m2.s

e)735nm LED紅外光源用于測(cè)量Fo’等

f)可選配藍(lán)色光源與7位濾波輪,用于GFP穩(wěn)態(tài)熒光測(cè)量

g)高靈敏度葉綠素?zé)晒獬上駥I(yè)CCD傳感器,1.4M分辨率, A/D 16比特,具備視頻模式和快照模式

h)測(cè)量參數(shù):Fo、FmFv、Fo'、Fm'、Fv'、Ft、Fv/Fm、Fv'/Fm'PhiPSII、NPQ、qN、qP、Rfd、ETR等,用于分析植物光合效率、適合度、生物與非生物脅迫及作物抗性、恢復(fù)力等

i)Fv/Fm、Kautsky誘導(dǎo)效應(yīng)、熒光淬滅分析等完備自動(dòng)化測(cè)量程序(protocols)與測(cè)量參數(shù),如Fv/Fm程序測(cè)量時(shí)間僅需10s

j)葉綠素?zé)晒鈹?shù)據(jù)在線分析,包括柱狀圖、測(cè)量參數(shù)圖、數(shù)據(jù)表格等,具備自定義圖像分割等功能

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4. 多光譜熒光成像模塊

·不僅可以運(yùn)行PAM葉綠素?zé)晒獬上?,還可以進(jìn)行GFP/YFP等熒光蛋白成像、多光譜熒光成像

·9種LED激發(fā)光源:UV(365nm)、青色光源(440nm)、藍(lán)色光源(470nm)、綠色光源(530nm)、琥珀色光源(590nm)、橙色光源(630nm)、深紅色光源(660nm)、遠(yuǎn)紅光源(730nm)及冷白光源(5700K)

·可成像分析多酚類(黃酮醇類、花青素等)、N素指數(shù)等

·分辨率1360x1024像素,binning 2x2、680x512像素

5. 紅外熱成像單元

·成像傳感器:焦平面陣列微測(cè)熱輻射計(jì),分辨率 640×480 像素,靈敏度30mK(0.03°C),波段7.5-13μm

·可選配高分辨率紅外熱成像,分辨率可達(dá)1024x768像素,靈敏度20mK(0.02°C)

·溫度范圍 -20 – 120℃,分辨率<0.03℃@30℃/30mK

·成像光源:冷白LED光源板,用于給測(cè)量植物提供穩(wěn)定熱環(huán)境,6500K,大光強(qiáng) 1000 µmol(photons)/m2.s,0-*可調(diào)

·具備溫度動(dòng)態(tài)Protocols,光照強(qiáng)度、持續(xù)時(shí)間、熱成像分布數(shù)據(jù)同步獲取,以研究分析植物溫度分布動(dòng)態(tài)等

·具備溫度參考傳感器(reference sensors)

·測(cè)量參數(shù):植物每一點(diǎn)的實(shí)際溫度,植物表面溫度分布圖

·專業(yè)分析軟件用于數(shù)據(jù)獲取、分析、存儲(chǔ)等

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6. NIR成像分析單元(選配):

·用于成像監(jiān)測(cè)分析植物水分狀態(tài)分布,具備假彩調(diào)色板,可以方便對(duì)比分析,快速監(jiān)測(cè)脫水植物,因而可以監(jiān)測(cè)評(píng)估干旱脅迫條件下植物水分的動(dòng)態(tài)變化響應(yīng)及水分利用效率等

·可與RGB成像形態(tài)結(jié)構(gòu)參數(shù)及FluorCam光合效率參數(shù)進(jìn)行相關(guān)分析等;可完整記錄追溯干旱過(guò)程與復(fù)水過(guò)程的動(dòng)態(tài)響應(yīng)等

·通過(guò)測(cè)量水分吸收光譜和940nm參考光譜,有效避免環(huán)境光及陰影效應(yīng)

·InGaAs傳感器,有效芯片大小9.6x7.7mm,波段范圍900-1700nm,分辨率638x510像素,幀頻118fps,A/D 14比特

·可選配頂部與側(cè)面雙鏡頭三維成像分析

·選配根系成像分析單元,以對(duì)根系進(jìn)行近紅外成像分析

7. 可見(jiàn)光-近紅外高光譜成像單元

· image.png成像波長(zhǎng)范圍:400-950nm(或350-900nm)

·成像傳感器:推掃式線性掃描傳感器,配備掃描光源

·像素色散:0.28nm/pixel

·光譜分辨率0.8nm FWHM

·光譜帶數(shù)(波段數(shù)):1920個(gè)波段

·空間分辨率:1000

·入射狹縫寬度:25μm

·幀頻:45fps

·CMOS檢測(cè)器,光圈F/2.0,GigE網(wǎng)絡(luò)接口

·自動(dòng)參考校準(zhǔn),線性掃描,高度可調(diào)

·測(cè)量參數(shù):每個(gè)波段的反射光譜成像圖及全光譜曲線,并可自動(dòng)計(jì)算以下植被指數(shù):歸一化指數(shù)NDVI、簡(jiǎn)單比值指數(shù)SR、改進(jìn)的葉綠素吸收反射指數(shù)MCARI、改進(jìn)的葉綠素吸收反射指數(shù)1MCARI1、化土壤調(diào)整植被指數(shù)OSAVI、綠度指數(shù)G、轉(zhuǎn)換類胡羅卜素指數(shù)TCARI、三角植被指數(shù)TVI、ZMI指數(shù)、簡(jiǎn)單比值色素指數(shù)SRPI、歸一化脫鎂作用指數(shù)NPQI、光化學(xué)植被反射指數(shù)PRI、歸一化葉綠素指數(shù)NPCI、Carter指數(shù)、Lichtenthaler指數(shù)、SIPI指數(shù)、Gison-Merzlyak指數(shù)、花青素反射指數(shù)等等

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8. 短波紅外高光譜成像單元

·成像波長(zhǎng)范圍:900-1700nm

·成像傳感器:推掃式線性掃描傳感器,配備掃描光源

·光譜分辨率:2nm(FWHM)

·光譜帶數(shù):510個(gè)波段

·空間分辨率636

·測(cè)量參數(shù):每個(gè)波段的反射光譜成像圖及全光譜曲線,無(wú)損測(cè)量植物整體及不同部位水分含量變化(右圖中藍(lán)色越深含水量越高)

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9. 3D激光掃描單元:

·頂部與側(cè)面激光掃描,660nm激光,用于植物精確3D模型構(gòu)建,分辨率低于1mm

·頂部掃描距離60cm,客戶定義側(cè)面掃描距離

·3D點(diǎn)云模型,RGB成像、葉綠素?zé)晒獬上駭?shù)據(jù)等可與3D模型疊加分析

·植物結(jié)構(gòu)、生物量、葉片數(shù)量、葉面積、葉片傾斜角度、植物高度等結(jié)構(gòu)形態(tài)參數(shù)

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